Dr.Tom系统中的GSEA工具
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      Dr.Tom系统中的GSEA工具
      8月15日 19:30-20:30

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老师介绍

  • 归佳栋

    归佳栋

    华大科技-技术支持工程师,研究生学历,从事NGS行业工作多年,主要涉及RNA、重测序及三代全长转录组方向。
简  介 Dr.Tom多组学数据挖掘系统近期新上线了GSEA基因富集工具,本课程期望和大家分享GSEA工具的原理和操作使用。

      GSEA全称为Gene Set Enrichment Analysis,是2003年提出来的一种对基因表达数据进行分析的方法,并被编制成软件。
      GSEA的分析原理需要两个关键的输入数据:1. 有待分析的数据集(data set)A,2. 已知功能信息的基因集(gene set)B(前人研究确定的注释功能),涉及的功能通常可以来自很多方面(例如具有相同或相似的功能,或位于同一染色体相邻位点的一群基因等等),我们暂且将不同的基因集命名为:B1、B2…Bn;而GSEA就是用于研究某个基因集Bn中的基因是随机分布在A中(A的基因已按照某种条件排序,如表达量、差值或者差异倍数等),还是显著聚集于A的前部或者后部(即富集)。如果基因集Bn中的若干基因显著富集在A的前部或者后部,这说明这些基因的表达水平对我们定义的分组(如处理组和对照组)有显著影响,从而找到大家关注的相关功能基因集。

      本期课程,华大基因的技术支持工程师归佳栋老师,为大家带来《Dr.Tom系统中的GSEA工具主题分享,一同深入了解新型的基因功能富集分析工具

 
课程主题:
Dr.Tom系统中的GSEA工具

 
课程大纲:
  • GSEA原理
  • GSEA基于Dr.Tom系统的操作
课程时间:
2019年8月15日 19:30-20:30

* 课程提供者:华大科技BGITech