GTEx联合TCGA数据库挖掘

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  • 乐老师

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    购买课程提供资料、答疑,请联系微信:18520221056。生信自学网biowolf.cn创建者,生信培训,肿瘤免疫浸润模式挖掘,ICGC数据库挖掘,GTEx分析。
简  介 GTEx联合TCGA数据库挖掘视频(解决TCGA正常样品少/解剖图)

适用人群

生物信息学学员,高校生物、计算机相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员

课程概述

课程内容:GTEx数据简介,GTEx和TCGA数据下载,GTEx数据库ID转换,统计各个器官表达量,解剖图绘制,箱体图绘制,提取GTEx对应组织表达,TCGA数据库分组,TCGA数据库ID转换,GTEx和TCGA数据合并,差异基因表达,热图绘制,生存分析输入文件准备,基因名字转换为基因ID,GO富集分析,GO圈图绘制,KEGG富集分析,KEGG圈图绘制。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。

GTEx(Genotype-Tissue Expression,基因型-组织表达)数据库,研究从来自449名生前健康的人类捐献者的7000多份尸检样本,涵盖44个组织(42种不同的组织类型),包括31个实体器官组织、10个闹分区、全血、2个来自捐献者血液和皮肤的细胞系,作者利用这些样本研究基因表达在不同组织和个体中有何差异。
GTEx对几乎所有转录基因的基因表达模式进行了观察,从而能够确定基因组中影响基因表达的特定区域。



 

* 课程提供者:生信自学网

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