TCGA数据库SNP突变数据分析

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森莘

森莘

生物信息学视频教学,TCGA数据库挖掘,GEO芯片分析,miRNA靶基因预测,lncRNA功能预测。
简  介 本课程是TCGA又一创新课程,首次分析SNP突变数据,是TCGA数据库挖掘的主要补充。课程内容包括,课程简介,突变数据下载,突变数据整理和统计;瀑布图输入文件准备,瀑布图绘制,带临床性状瀑布图数据准备,绘制带临床数据的瀑布图;突变和表达关系数据准备,绘制突变和表达关系图;提取生存时间,生存分析。

适用人群

生物信息学学员,高校生物、计算机相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员

课程概述

本课程是TCGA又一创新课程,首次分析SNP突变数据,是TCGA数据库挖掘的主要补充。课程内容包括,课程简介,突变数据下载,突变数据整理和统计;瀑布图输入文件准备,瀑布图绘制,带临床性状瀑布图数据准备,绘制带临床数据的瀑布图;突变和表达关系数据准备,绘制突变和表达关系图;提取生存时间,生存分析文件准备,生存分析;SNP位点数据整理,位点矩阵和表达矩阵合并,位点突变和基因表达关系,位点生存分析文件准备,位点生存曲线绘制。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。

* 课程提供者:生信自学网-速科生物

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