小张聊科研微信公众号自筹课程
2. 主讲教师
华老师,985本硕博,遗传学博士。有五年多的生物信息学分析经验,参与过多项研究课题,包括ceRNA测序数据分析、全基因组关联分析、遗传群体重测序QTL定位、TCGA/GEO等数据库挖掘、基因家族进化分析等,发表过多篇数据挖掘SCI文章,在数据挖掘发文思路方面有自己的心得。
3. 课程介绍
本课程系统地讲解如何利用GEO数据库进行生信分析,涵盖课题设计、数据整合和分析方法多个方面,课程内容丰富包括:GEO数据的检索、上传及下载,筛选差异基因,火山图/热图/circos图等绘制,GSEA分析,Meta分析等。期间会跟大家介绍基本概念和详细实操代码,从头复现3到5分的GEO SCI文章,为您的科研工作助力。
4. 课程内容
本系列课程每周一至少更新两节课,以下列出的内容都会涉及到,具体课程内容如下
一、GEO数据库基本简介
1. GEO数据库简介及检索
2. GEO数据下载
3. GEO数据上传
二、GEO文章设计思路
1. IF一到三分GEO文章解析
2. IF三到五分综合文章套路
3. 总结—近三年GEO文章要点及未来趋势
三、GEO数据挖掘实操
以五分GEO文章为例复现其中的GEO分析(芯片数据)
1. 文章解析
2. 差异表达分析(包括count数据的处理和fpkm类数据的处理)
3. 作图:箱线图、韦恩图、火山图、热图、Circle图
4. 差异基因功能、通路富集分析,包括GO分析及作图、KEGG分析及作图
5. PPI互作网络构建
6. GSEA分析
四、Meta在线分析
1. Meta分析简介及示例文章讲解
2. 复现一篇IF五分Meta文章:
Network Analyst-Meta分析、差异基因富集分析、互作网络构建
3. ImaGO-meta分析工具
数据库使用、代码详解
Q&A
1、本系列课程是否适合我?
本课程为基础课程,但是需要有R语言基础,没有R基础并且不想自学R代码的,不建议购买。
2、本系列课的有效期多长?是否可以重复观看?在哪儿观看?是否可以下载?
本系列课购买后可以无限制重复观看,但不可下载。观看有效期至2025年3月。
观看方式如下:
通过购买课程的微信或QQ登录腾讯课堂,在我的课程里即可找到报名的课程。另外也可以通过手机下载“腾讯课堂”APP,使用购买课程的微信或QQ登录即可。
注:由于是电脑演示,所以通过电脑浏览器观看效果更佳。
3、本课程不在苹果公司iOS app上架,使用Mac的学员请使用Safari或Chrome浏览器登录腾讯课堂网页进行购买观看。
4、购买本系列课程后是否可以开票?
购买本系列课程后,请联系猫头鹰班长(微信:xzlky2015-training)获取发票,添加好友请表明“发票索取”。
需开票学员,请向猫头鹰班长索取发票信息表并填写。