TCGA数据库差异表达分析和转录因子调控网络

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TCGA转录因子调控

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森莘

森莘

生物信息学视频教学,TCGA数据库挖掘,GEO芯片分析,miRNA靶基因预测,lncRNA功能预测。
简  介 本课程讲解TCGA数据库差异表达分析和转录因子调控网络,是TCGA又一创新课程,是TCGA转录因子分析的重要学习课程。

适用人群

生物信息学学员,高校生物、计算机相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员

课程概述

本课程讲解TCGA数据库差异表达分析和转录因子调控网络,是TCGA又一创新课程,是TCGA转录因子分析的重要学习课程。课程内容包括TCGA转录因子调控网络课程简介,TCGA官网数据下载,TCGA命令行下载数据,TCGA数据整理,Ensembl转换成symobl,提取mRNA,mRAN差异表达,差异mRNA热图绘制;提取lncRNA,lncRNA差异表达,差异lncRNA热图绘制,TCGA转录因子富集分析,转录因子调控网络文件准备,Cytoscape的下载和安装,转录因子调控网络可视化。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。

* 课程提供者:生信自学网-速科生物

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