植物转录因子分析

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老师介绍

  • Marble

    Marble

    生物信息学硕士,具备多年生物信息分析与研发经验,曾长期担任国内某知名生物测序公司研发经理一职
简  介 植物转录因子的调控关系分析
一、课程背景
       在转录调控研究中,有一类基因通常是重点关注的,即转录因子(Transcription Factor, TF)。转录因子是一类能与基因5`端上游特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。TF的核心功能就是能调控其他基因的表达,因此在各种基因表达调控网络和信号转导通路中都处于重要调控位置。
      随着转录组测序等高通量测序技术发展,在构建基因调控网络时通常需要对数据进行批量的TF分析,主要包括转录因子的预测和注释、DNA结合motif的分析、转录因子和靶基因的调控关系等。如2017年发表在Plant Cell的JA基因调控网络的文献,通过重点分析转录因子及其DNA结合motif的富集分析,构建MeJA诱导的转录因子和靶基因的有向调控网络(Hickman,2017)。





















二、课程内容



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* 课程提供者:PlantTech(普朗泰科)学院

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