Perl语言在生物信息学中的应用

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  • 森莘

    森莘

    生物信息学视频教学,TCGA数据库挖掘,GEO芯片分析,miRNA靶基因预测,lncRNA功能预测。
简  介 主要讲解Perl语言在生物信息学语言的应用。第一部分主要介绍Perl的数据结构,包括标量、数组、向量、引用、正则表达式和读写文件。 第二部分是光俊老师总结的一些常见的Perl在生物信息学应用,包括多实验GEO数据合并,gene symbol转换成gene id,序列GC含量统计,核酸苷编码氨基酸序列,生物信息学任务调度,以及目录操作。
此视频主要讲解Perl语言在生物信息学语言的应用。视频分为两部分,第一部分主要介绍Perl的数据结构,包括标量、数组、向量、引用、正则表达式和读写文件。
第二部分是光俊老师根据生物信息学编程经验,总结的一些常见的Perl在生物信息学应用,包括多实验GEO数据合并,gene symbol转换成gene id,序列GC含量统计,核酸苷编码氨基酸序列,生物信息学任务调度,以及目录操作。这些脚本是学员在学习生物信息学的过程中,经常希望定制化的脚本。

* 课程提供者:生信自学网-速科生物

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