TCGA数据库RNA-seq分析最详细全流程
  1. TCGA数据下载及整合

    1. 录播
      新版TCGA官网介绍
      14分钟
    2. 录播
      TCGA数据下载及API接口分析
      13分钟
    3. 录播
      TCGA数据整理思路python编程
      16分钟
    4. 录播
      ID注释及lncRNA提取python编程
      18分钟
    5. 录播
      TCGA相关网站UCSC-Xena的应用
      16分钟
  2. TCGA数据库RNA-seq数据差异基因分析流程

    1. 录播
      DeSeq2,edgeR,limma差异分析
      9分钟
    2. 录播
      DeSeq2,edgeR,limma代码分析实战
      21分钟
    3. 录播
      差异基因火山图,热图,PCA,VENN
      17分钟
    4. 录播
      clusterprofiler通路富集分析
      20分钟
  3. TCGA数据库RNA-seq数据进阶分析流程

    1. 录播
      医学人工智能潜力数据库STRING
      10分钟
    2. 录播
      用最流行的网络图绘制软件Cytoscape绘制PPI
      11分钟
    3. 录播
      加权共表达网络WGCNA分析最详细实战讲解
      20分钟

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老师介绍

  • 雷老师

    雷老师

    雷枪医学信息技术(广州)有限公司创始人及技术顾问。精通R,python,golang等编程语言,有三年生物信息学及临床数据分析经验,以第一作者发表SCI论文多篇。
简  介 TCGA数据库RNA-seq分析最详细全流程,帮助您快速使用TCGA数据库数据下载及作图分析,帮助您发表研究论文
雷枪医学信息技术出品的TCGA数据库系列视频教程,帮助您快速使用TCGA数据库数据下载及作图分析,帮助您发表研究论文。

课程目录:
  1. TCGA数据库官网简介
  2. 数据下载与整合,API接口分析
  3. 数据整理编程思路(python)
  4. lcnRNA提取与ID注释(python)
  5. UCSC Xena应用
  6. 差异基因三大包Deseq2, edgeR, limma简介
  7. 差异基因三大包Deseq2, edgeR, limma使用
  8. 差异基因绘图PCA,热图,维恩图,火山图
  9. 蛋白质互作数据库string
  10. 网络图绘制软件CYTOSCAPE
  11. 加权共表达网络WGCNA分析


 

* 课程提供者:雷枪医学信息技术(广州)有限公司