实用数据库挖掘

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课程概述

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老师介绍

  • 依凡

    依凡

    小张聊科研团队的资深学霸级,多年从事生物信息学和医学相关研究,主要致力于医学大数据挖掘和软件开发,发表多篇SCI文章;参与“十二五”,863,973,国自然等多项国家级项目;拥有丰富授课经验。
简  介 课程从实例出发,针对科研工作中最常用到的数据库,涉及序列数据库,芯片数据库,测序数据库,注释数据库,肿瘤数据库等等,结合文献实例的学习和动手操作,循序渐进地带领大家一步步从数据挖掘的“门外汉”到体会数据挖掘的乐趣。
1. 机构的品牌信息  
小张聊科研微信公众号自主开发课程  

2. 课程的师资情况(包括老师和助教)  
依凡 小张聊科研团队的资深学霸级顾问,多年从事生物信息学和医学相关研究,主要致力于医学大数据挖掘和软件开发,发表多篇SCI文章;参与“十二五”,863,973,国自然等多项国家级项目;   拥有丰富交流唠嗑经验,听了依凡大大的课后绝对让你有耳目一新忽然开朗的感觉哟。  

3. 课程的服务特色  
本课为实操课,手把手教学。

4、课程目录
课程内容
第1节 直播课-数据库挖掘案例解析 第25节 23.WGCNA基础
第2节 直播课-GEO数据库挖掘实操课 第26节 24.WGCNA实例(上)
第3节 01.数据挖掘绪论 第27节 25.WGCNA实例(下)
第4节 02.序列数据库(Genbank) 第28节 26.肿瘤数据挖掘绪论
第5节 03.序列数据库(分析软件与文献实例) 第29节 27.UCSC-1
第6节 04.R语言基础1 第30节 28.UCSC-2
第7节 05.R语言基础2 第31节 29.Ensemble(简介)
第8节 06.R语言基础3 第32节 30.Ensemble(文献导读与实例操作)
第9节 07.R语言基础4 第33节 31.Oncomine-1
第10节 08.GEO简介与检索 第34节 32.Oncomine-2
第11节 09.GEO在线分析工具 第35节 33.COSMIC数据库
第12节 10.差异表达基础理论 第36节 34.TCGA
第13节 11.差异表达分析实操 第37节 35.cBioportal
第14节 12.整合转录组数据分析 第38节 36.高通量测序基础理论
第15节 13.层次聚类 第39节 37.DNASeq基础理论
第16节 14.主成分分析 第40节 38.Linux与Shell
第17节 15.注释数据库KEGG_GO 第41节 39.WES和WGS分析流程
第18节 16.功能富集分析 第42节 40.WES和WGS实例操作(上)
第19节 17.Cytoscape入门 第43节 41.WES和WGS实例操作(下)
第20节 18.KEGG通路绘制 第44节 42.RNASeq基础理论
第21节 19.String蛋白互作数据库 第45节 43.RNASeq差异表达
第22节 20.Hub基因分析 第46节 44.LIS、HIS系统的妙用
第23节 21.GSEA-1 第47节 45.数据上传
第24节 22.GSEA-2    

*由于学习资料较多,现将学习资料整理打包放在第3节课(01.数据挖掘绪论 )中,并分别将对应课时中的资料单独建立了文件夹,方便大家阅读

本课程共计47节课,总时长近20小时。

本系列课的内容:此系列课以实用为基础,涵盖非编码RNA、肿瘤多组学研究、二代测序数据挖掘等多个研究热点。涉及多个数据库,包括肿瘤数据库TCGA,cBioPortal,SRA,COSMIC;表达谱数据库GEO,Oncomine;基因组数据库UCSC,Ensembl;序列数据库GenBank,Uniprot等。重点讲解数据库挖掘的常用工具,如R语言,linux系统操作以及常用分析软件。同时结合文献实例,引导性教学,深入讲解实用分析方法,如层次聚类,主成分分析,功能富集等常规分析和靶基因预测,共表达网络,GSEA等高级分析方法。

 

Q&A

1、本系列课程是否适合我?

本课程主要是结合文献实例的学习和动手操作,循序渐进地带领大家认识数据库挖掘,面向于没有时间进行“湿实验”的临床医生或医学生;对于基础研究不熟悉的人员;想从芯片、测序海量数据中,获取有效的信息的科研人员;以及想通过生信分析提升研究基础的各类基金申报人员。

2、本系列课的有效期多长?是否可以重复观看?在哪儿观看?是否可以下载?

本系列课购买后可以无限制重复观看,但不可下载。观看有效期至2022年6月30日。

观看方式如下:

电脑通过购买课程的QQ登录腾讯课堂,即可观看。另外也可以通过手机下载“腾讯课堂”APP,使用购买课程的QQ登录即可。

注:由于是电脑演示,所以通过电脑chrome浏览器观看效果更佳。

3、购买本系列课程后是否可以开票?

购买本系列课程后,请联系猫头鹰班长(微信:xzlky2015-traning)获取发票。

4、注意:本课程无微信或qq群。

资料下载报名后支持下载

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* 课程提供者:上海解颐生物科技有限公司