课程简介

表观遗传学（Epigenetics）与传统遗传学不同，是一门专门研究在“非DNA序列变化”情况下，遗传信息通过某些机制或途径传递给子代并对子代产生影响的新兴学科。尤其是2006年以Illumina为代表的第二代测序技术建立后，表观遗传学的研究开启了新的时代。

表观遗传学的研究核心还是在于不同层次转录调控的研究。应用第二代测序技术，科学家们针对不同层次的转录调控阶段开发了等一系列测序技术进行研究，硕果累累。比如，针对DNA结合蛋白在全基因组结合位点分布的探索，开发了ChIP-seq技术；针对染色质开放程度的衡量，开发了DNase-seq，ATAC-seq技术；针对基因组甲基化水平的探索，开发了BS-seq；针对三维层次的调控研究，开发了Hi-C技术等。这些技术从不同层次，不同角度，不同维度衡量了非DNA序列对基因转录、表达的调控与影响，使我们进一步了解到生物体调控机制的复杂与精密。

目前，国内外已有多个表观遗传学分析课程，但系统性的从基因组学背景及转录调控的分子生物学角度出发，对不同表观遗传学相关测序技术进行原理、算法、数据分析实践层面的讲解，并结合当前最新研究成果以及相关研究领域进展进行讨论的课程还处于空白。基于此，我们推出本次课程——“高级生信系列课程：表观遗传学数据分析”

本次课程是“高级生信系列课程”的第四门课。重点针对ChIP-seq技术及改进技术（CUT&RUN，CUT&Tag，in situ ChIP），DNase-seq，ATAC-seq等技术从原理、算法、数据分析实践等方面进行讲解。

特别说明

本次课程不涉及甲基化数据分析；本次课程会对Hi-C测序技术的基本原理进行介绍，但不会进行数据分析实操。

本次课程会带着大家对真实的数据进行分析，并把全部代码及可视化绘图结果分享给大家！

授课老师介绍

毕业于北京大学生命科学学院，获理学博士学位，在多年学习生物信息学分析的过程中积累了大量经验，很愿意分享给大家。
之前在某乎平台，孟浩巍博士创建了一系列在线课程，先后有上万人参与并获得全部好评，相关图文教程获得900W次阅读。

在过去几年中，研究方向主要为基因组学，表观遗传学，基因编辑领域，先后在Nature，Nature Methods， Nature Chemical Biology, Molecular Cell以共同第一作者或作者身份发表了多篇研究论文。在生物信息学数据分析实践等方面积累了大量经验。

课程PPT截图