16S测序数据分析
  1. 课程介绍

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      课程介绍
      9分钟
  2. 微生物分类简介

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      微生物与人类
      8分钟
    2. 录播
      微生物物种分类
      10分钟
    3. 录播
      微生物鉴定方法比较
      11分钟
  3. 16S物种分类

    1. 录播
      16S物种分类
      8分钟
    2. 录播
      16S样品提取与测序
      9分钟
    3. 录播
      几种16S测序技术的比较
      9分钟
    4. 录播
      16S测序分析常用分析流程
      10分钟
  4. 16S常用数据库

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      16S测序分析常用数据库
      11分钟
    2. 录播
      18S和ITS数据分析
      7分钟
  5. HMP计划与EMP计划

    1. 录播
      HMP计划与EMP计划
      9分钟
    2. 录播
      纪念Carl Woese
      8分钟
  6. 数据质控与处理

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      测试数据
      8分钟
    2. 录播
      16S测序数据质控
      10分钟
    3. 录播
      16S测序数据处理
      9分钟
  7. Qiime软件安装

    1. 录播
      qiime-base安装
      8分钟
    2. 录播
      qiime-full安装
      8分钟
    3. 录播
      qiime虚拟机安装
      14分钟
    4. 录播
      qiime的使用
      9分钟
  8. 获取OTU

    1. 录播
      mapping文件
      6分钟
    2. 录播
      序列连接
      8分钟
    3. 录播
      切分数据
      7分钟
    4. 录播
      切分fastq数据
      8分钟
    5. 录播
      去除嵌合体
      6分钟
  9. OTU分析

    1. 录播
      OTU物种分类
      10分钟
    2. 录播
      OTU聚类
      8分钟
    3. 录播
      选择代表性OTU
      7分钟
    4. 录播
      参考序列比对
      7分钟
    5. 录播
      过滤比对结果
      5分钟
    6. 录播
      构建进化树
      6分钟
    7. 录播
      物种分类注释
      9分钟
    8. 录播
      OTU table
      6分钟
    9. 录播
      biom文件格式
      8分钟
    10. 录播
      OTU table处理
      8分钟
  10. OTU分析流程

    1. 录播
      OTU分析流程(一)
      9分钟
    2. 录播
      OTU分析流程(二)
      10分钟
    3. 录播
      OTU分析流程(三)
      7分钟
    4. 录播
      群落组成分析
      9分钟
    5. 录播
      绘制OTU热图
      7分钟
    6. 录播
      绘制OTU Network图
      7分钟
  11. beta多样性分析

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      多样性分析
      9分钟
    2. 录播
      beta多样性分析(一)
      9分钟
    3. 录播
      beta多样性分析(二)
      9分钟
    4. 录播
      beta多样性分析(三)
      10分钟
  12. alpha多样性分析

    1. 录播
      alpha多样性分析(一)
      8分钟
    2. 录播
      alpha多样性分析(二)
      8分钟
    3. 录播
      alpha多样性分析(三)
      10分钟
  13. 其他分析

    1. 录播
      Rank-Abundance曲线
      6分钟
    2. 录播
      多样性分析流程
      8分钟
    3. 录播
      16S高级分析简介
      9分钟

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老师介绍

  • 王通

    王通

    曾任职国内某大型基因机构高级讲师,8年以上生物信息工作经验,已制作生物信息教学视频500集以上,参与培训20多场,累计学员超过3000名以上。
简  介 本课程从微生物分类基础知识入手,然后介绍16S测序技术,包括提取测序,数据质控过滤,处理等,并详细介绍16S数据分析,包括分析软件,数据结果解读,常见问题等。同时课程中包括大量分析脚本的详细介绍和操作演示,是一套非常全面的16S测序生物信息教学视频。
关注微信公众号“基因学苑”,后台回复“16S”获取脚本及数据

* 课程提供者:王通

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