重测序系列课程

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老师介绍

  • 周老师

    周老师

    OmicShare在线课堂首席讲师,江湖人称“周老师”。有丰富的高通量测序数据挖掘经验,精通统计学、R语言、重测序等领域。现为广州基迪奥生物技术总监,负责公司基因组、转录组、表观组和蛋白组项目设计。曾经参与项目并发表文章在nature、PNAS、BMC genomics、Genomics等期刊。
简  介 随着二代测序价格各种跳楼,全基因组重测序已经越来越趋于白菜价了。所以,重测序也越来也广泛应用到遗传学研究的方方面面。从动植物QTL定位到群体遗传研究,从人类孟德尔病到复杂疾病,重测序(或者外显子测序、简化基因组测序等相关技术)在多个领域大显身手。那么重测序数据分析的流程是什么呢?
基迪奥Omicshare为广州基迪奥生物创立的,专注做生物信息交流学习的线上平台。     

OmicShare官网:百度搜索OmicShare 

随着二代测序价格各种跳楼,全基因组重测序已经越来越趋于白菜价了。所以,重测序也越来也广泛应用到遗传学研究的方方面面。从动植物QTL定位到群体遗传研究,从人类孟德尔病到复杂疾病,重测序(或者外显子测序、简化基因组测序等相关技术)在多个领域大显身手。那么重测序数据分析的流程是什么呢?本系列课程将会带你从原始数据到后续高级分析,解决重测序数据分析的流程中每个步骤可能出现的问题。

本系列课程内容设置如下:

1,重测序比对变异与检测

重测序比对与变异检测(上)——比对篇

重测序比对与变异检测(下)——变异检测篇

2,谈谈RNA-seq和GWAS中的p value 和 Q value

谈谈RNA-seq和GWAS中的pvalue和Qvalue

3,群体遗传与进化选择

群体遗传与进化选择技术交流

4,全基因关联分析 (GWAS)技术交流

全基因组关联分析(GWAS)技术交流

5,混合分组分析(BSA)

混合分组分析(BSA)专题——用好BSA并没那么简单

6,基因组浏览器(IGV)使用教程

基因组浏览器(IGV)使用教程

7,QTL定位的方法与实操实现
QTL定位的方法与实操实现

 

难度:两颗星

目标:解决重测序数据分析的流程中每个步骤可能出现的问题。学会使用基因组浏览器(IGV)。

答疑:在学习本系列课程中,如有任何问题,可加入我们的生信交流群(154447756)交流。

* 课程提供者:基迪奥生物

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