课程简介

一、转录组的应用、设计和案例分享

1. 转录组学研究技术介绍

2. 转录组学实验设计和测序原则、注意事项

3. 转录组学文章案例分析

4. 在线基因表达资源数据库

二、转录组分析流程实战

1. 测序数据质量评估和清洗

2. 基于比对的差异基因分析

3. 不基于比对的差异基因分析

4. 转录本组装和选择性剪接分析

5. 目标基因富集分析

三、转录组高级分析

1. WGCNA基因共表达分析

2. WGCNA基因、表型关联分析

3. Cytoscape 共表达网络绘制

4. 转录组常见图形在线绘制

四、三代测序技术概述

1. PacBio和Oxford Nanopore测序的原理

2. 三代测序的特点和应用

3. 三代测序在转录组研究的优势和案例分享

五、三代测序基本分析流程

1. 原始测序序列去除接头和错误序列

2. 提取环形一致序列读长(CCS reads)

3. CCS reads分类(包括全长和非全长CCS reads)

4. CCS reads聚类(根据CCS reads序列的相似性)获得最终的转录本集合

5. 最终转录本比对回基因组

6. 转录本定量和可变剪接分析

(不同版本会有细微差别，具体流程以实战专家讲述为主。)

如果您有其它关注的问题，也请报名时提出，把这次课程变成您的定制讲解。

主讲教师

主讲老师包括爱荷华大学、中科院微生物所、遗传发育所、基因组所、生物物理所等多名本领域一线技术专家。

助教团队

十余名科学院、清华、北大博士(含在读)，轮值讲师和助教，辅助学员学习和矫正培训过程中不足的点。

成为实验中不可或缺的人，赶快报名吧！

• NGS基础 - FASTQ格式解释和质量评估

• NGS基础 - 高通量测序原理

• NGS基础 - 参考基因组和基因注释文件

• NGS基础 - GTF/GFF文件格式解读和转换

• 本地安装UCSC基因组浏览器

• 测序数据可视化 (一)

• IGV基因组浏览器可视化高通量测序数据

• 测序文章数据上传找哪里

• GO、GSEA富集分析一网打进

• GSEA富集分析 - 界面操作

• 去东方，最好用的在线GO富集分析工具

• 生信软件系列 - NCBI使用

精品回顾

画图三字经 生信视频 生信系列教程 心得体会 癌症数据库 

高通量分析 Linux Python 在线画图