转录组差异分析与作图-无需编程
  1. 可视化差异分析工具介绍-DEBrowser

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      可视化差异分析工具介绍-DEBrowser
      15分钟
  2. 实践-数据预处理和质控

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      数据预处理和质控
      12分钟
  3. 实践-差异分析及作图

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      差异分析及作图
      10分钟

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简  介 交互性可视化差异分析工具-DEBrowser,基于R的基础架构构建的交互式基于Web的图形用户界面。以交互方式可视化差异分析的每个步骤,无需编程。
一、 课程背景
     差异分析是组学数据分析中常见且非常重要的数据分析步骤,如RNA-seq、iTRAQ定量蛋白组等。转录组数据通过差异分析确定哪些基因在不同条件下呈现上下调趋势,数据分析过程复杂,通常用DEseq、EBseq、edger等(R包)来实现。这些软件都是基于R语言而写的工具包,对于没有生信基础的人而言比较困难。 本课程介绍一个交互性可视化差异分析工具-DEBrowser,基于R的基础架构构建的交互式基于Web的图形用户界面。 以交互方式可视化差异分析的每个步骤,无需编程。
二、课程目标
无需编程,用DEBrowser直接获取以下差异分析结果

差异基因散点图、火山图、MA图

样品PCA图

差异基因聚类热图

样品相关性分析
 
重要:购买课程后一定要添加“课程妹”微信,“课程妹”将提供答疑等各种问题

* 课程提供者:PlantTech(普朗泰科)学院

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