课程通过讲解多篇WGCNA文献,帮助科员人员、学生等能快速掌握对应的分析逻辑,学会基于公共数据库数据开展类似的分析,挖掘自己研究邻域内的有效数据信息从而方便开展今后的实验。
文献讲解
1、基于WGCNA筛选过敏性哮喘相关biomarker
利用上呼吸道样品数据进行WGCNA分析筛选hub genes,并对筛选的结果进行ROC曲线验证。
2、基于WGCNA筛选宫颈癌相关预后因子
利用宫颈癌数据进行WGCNA分析筛选预后因子,并利用其他的公共数据及网站进行验证。
3、基于WGCNA分析乳腺癌相关的重要lncRNAs
根据WGCNA分析挖掘乳腺癌相关蛋白质编码基因和lncRNAs之间的网络,并筛选关键的lncRNAs进行验证。
4、基于WGCNA分析玉米株高相关基因互作网络
利用转录组测序数据进行WGCNA分,并结合差异基因,构建玉米株高相关基因的共表达网络
网站操作
1、基于UALCAN网站进行癌症相关基因表达数据获取已经生存曲线绘制。
2、利用KM-plotter网站对癌症基因进行生存曲线绘制。
3、利用Metascape进行基因注释富集分析。
课程介绍
课程目录
往期学员作品
用户评论
课程介绍
课程目录
往期学员作品
用户评论
你将获得
- 掌握某些知识点
- 学会某些技巧(或思路)
教学服务
1v1专属答疑服务
BAT专家面试辅导
讲师介绍
omicsgene
首席讲师
具备多年高通量测序数据生物信息分析与研发经验,曾长期担任国内某知名生物测序公司研发总监一职,深入开发DNA重测序(GWAS,遗传进化等等),转录组,微生物多样性,TCGA与GEO数据挖掘等分析流程。擅长perl,python,R等编程语言。
课程详情
温馨提示
- 请勿私下交易请勿在平台外交易。与机构和老师私下交易造成的任何损失及纠纷,腾讯课堂不承担任何责任
- 听课说明
1、电脑:访问腾讯课堂官网 ke.qq.com 查看我的课表或下载win/mac客户端听课
2、手机/平板:下载腾讯课堂APP, 进入学习页面听课