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你将获得

  • 掌握某些知识点
  • 学会某些技巧(或思路)

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    BAT专家面试辅导

讲师介绍

  • 具备多年高通量测序数据生物信息分析与研发经验,曾长期担任国内某知名生物测序公司研发总监一职,深入开发DNA重测序(GWAS,遗传进化等等),转录组,微生物多样性,TCGA与GEO数据挖掘等分析流程。擅长perl,python,R等编程语言。

  • 课程详情

    课程通过讲解多篇WGCNA文献,帮助科员人员、学生等能快速掌握对应的分析逻辑,学会基于公共数据库数据开展类似的分析,挖掘自己研究邻域内的有效数据信息从而方便开展今后的实验。
    文献讲解
    1、基于WGCNA筛选过敏性哮喘相关biomarker
         利用上呼吸道样品数据进行WGCNA分析筛选hub genes,并对筛选的结果进行ROC曲线验证。
    2、基于WGCNA筛选宫颈癌相关预后因子
          利用宫颈癌数据进行WGCNA分析筛选预后因子,并利用其他的公共数据及网站进行验证。
    3、基于WGCNA分析乳腺癌相关的重要lncRNAs
         根据WGCNA分析挖掘乳腺癌相关蛋白质编码基因和lncRNAs之间的网络,并筛选关键的lncRNAs进行验证。
    4、基于WGCNA分析玉米株高相关基因互作网络
         利用转录组测序数据进行WGCNA分,并结合差异基因,构建玉米株高相关基因的共表达网络
    网站操作
    1、基于UALCAN网站进行癌症相关基因表达数据获取已经生存曲线绘制。
    2、利用KM-plotter网站对癌症基因进行生存曲线绘制。
    3、利用Metascape进行基因注释富集分析。
    温馨提示
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