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  • 所有新课程全部在百因平台(www.bioinfo.info)

  • 课程详情

    个人简介
    大家好,我是孟浩巍。很高兴能够在腾讯课堂与大家见面!


    我目前就读与北京大学生命科学学院,正在攻读博士学位,在5年学习生物信息学分析的过程中积累了大量经验,很愿意分享给大家。
    之前在某乎平台,我创建了一系列在线课程,先后有6000人参与并获得全部好评。

    此外,我还创建了名为【生信坑】的生物信息学问答网站,欢迎大家有问题到网站上进行交流!我们在【生信坑】也会每周推送生信领域最信,最热的文章,并进行简要导读。网址:www.bioinfo.info


    课程介绍
    根据生物信息学数据分析的实战经验,我们推荐大家首先学习R语言及其相关的操作,这样能够最快地让大家把很多生物信息学数据可视化,并得出一定的统计学分析结论,而这些结论往往可以帮助我们进一步理解生物学问题。

    那么我们本次课程主要是针对生物信息学进行一次更加深入地学习,主要是介绍R与Bioconductor的相关内容。

    Bioconductor可以简单理解为基于R语言专门做生物信息学分析的众多工具包的集合,通过使用Bioconductor你可以快速地查找公共数据与公共资源;快速地对芯片数据,高通量数据进行分析与可视化;快速地进行若干生物信息学相关的各种分析。

    总之,你如果想学习如何做生物信息学却不知道或者不会使用R与Bioconductor,那你就错过了一个事半功倍的利器!

    课程主要内容
    1. R语言与Bioconductor的背景介绍
    2. Bioconductor网站浏览
    3. Bioconductor的安装与源的选择
    4. R语言基础语法的简单回顾
    5. Bioconductor最常用的包
        - AnnotationHub
        - GenomicRange
        - BSgenome
        - Biostrings
        - GenomicFetures
        - rtracklayer
        - Gviz
    6. ChIP-Seq的数据分析
        - 提取基因组序列信息
        - 转换 gene id
        - 计算genome 的 intron与exon长度
        - 可视化基因结构