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讲师介绍

  • 购买课程提供资料、答疑。生信自学创建者,生信培训,肿瘤免疫浸润模式挖掘,ICGC数据库挖掘,GTEx分析。

  • 购买课程提供资料、答疑。生物信息学视频教学,TCGA数据库挖掘,GEO芯片分析,GO、KEGG、GSSEA富集分析,肿瘤免疫浸润模式挖掘,ICGC数据库挖掘,GTEx分析。

  • 课程详情

    适用人群

    生物信息学学员,高校生物、计算机相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员

    课程概述

    TCGA数据库ATAC-seq挖掘视频(染色质开放性/peak/motif/调控因子)
    本课程为连载课程,课程第一次发布4个课时,接下来每天更新5个课程,一共19个课程,将在发布后3天更新所有的课程内容
    课程主要内容包括:
    TCGA数据库ATAC-seq简介
    ATAC数据下载
    ATAC数据整理
    覆盖度图
    基因组特征图
    Upset图绘制
    TSS柱状图
    绘制热图
    TSS距离分布
    GO富集分析
    KEGG富集分析
    bed转换为fasta
    motif查找和注释
    mRNA数据下载
    mRNA数据合并
    Ensembl转换为基因名
    peak和mRNA矩阵合并
    相关性分析
    相关性结果注释
    本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。
    *学习课程评价课程后请联系 微信:18520221056,获得更多帮助。




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