蛋白质组学本质上指在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白表达水平、翻译后修饰、蛋白互作等，由此获得蛋白质水平上关于生长发育、抗病和抗逆等过程的整体而全面的认识。
随着质谱技术的发展，且蛋白质与生物功能联系更直接，使用蛋白质组比转录组能更有效地解析相关生物学问题的分子机制，蛋白质组得到了广泛的应用。
iTRAQ定量蛋白质组是采用4种或8种同位素标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，进行串联质谱分析从而比较不同样品中蛋白质的相对含量。
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