系统进化树绘制

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进化树1

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老师介绍

  • 石小云

    石小云

    博士毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,秉承“bioinformatics for biology”的理念,提供面向植物领域的生物信息学培训。
简  介 本课程实操演示MEGA构建基因或SNP进化树,Figtree、Evolview和iTOL美化优化树,如进化树+表达量热图/蛋白结构域/文本/图片/点图等。
一、课程背景
        系统进化树(Phylogenetic tree)是用一种类似树状分支图形来概括各节点之间的进化关系,节点可以是不同物种、同一物种不同样本、不同基因等。可体现物种进化关系和演化历程,群体内部样本亲缘关系,基因家族成员分类和进化关系等。
二、课程内容

三、课程目标
基因家族进化树+表达量热图
基因家族进化树+蛋白结构域
基于SNP的群体进化树+点图
基于SNP的群体进化树+文本或图片

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* 课程提供者:PlantTech(普朗泰科)学院

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