课程详情

开了多期 转录组、扩增子和宏基因组等 (后台回复 对应课程名字 获取视频连接)实战培训，发现绝大部分实验室手中都有测序公司返回的数据分析报告，并且有一些分析是基于这些报告，但部分情况是拿到报告，老师们不知道如何利用公司测序报告中的数据表做后续个性化分析。

出现这一困境的原因只有一个：时间不够用。

为了加速大家的分析进程，我们这次推出生信分析Linux基础和R绘图课，包含常见组学技术的原理、应用和概念，R语言基础绘图，Windows下使用Linux命令快速提取数据和准备绘图所需的文件，常见组学图形的解读和绘制等，希望能促进快速分析手上的数据，把数据表格转变为发表级的分析图。

比起之前的生信实战课，本次课程内容将不涉及高通量数据标准分析流程，但是报名后会赠送一门往期实战分析网课一门（测试数据和代码可下载）。

本期课程是贴近定制分析的一门技能课，我们将带你体验在终端运行代码来处理数据矩阵的快感，再也不用担心你的Excel因庞大的数据而断片，助你成为实验室高效率的人，在别人重启电脑的时间完成数据转换和出图！

每节课1小时一个主题，理论结合实战，学懂原理，实战实操，全是老司机多年经验和代码的无私分享。下面是课程安排，如11代表第一天第一节课，26代表第二天第六节课，(实际上课会有调整，理论和实战穿插调和)41为两周后的线上集中视频答疑。

编号	主题	简介
11	生物信息是什么	能解决哪些问题，有哪些应用
12	高通量技术概述	高通量测序应用的种类、概念、原理和用途介绍，二代三代测序的优缺点
13	组学和生物调控	案例解析
14	KEGG/Reactome/GO通路图表达属性可视化	Cytoscape,模式和非模式生物
15	GSEA富集分析	GSEA本地富集分析工具使用
16	常见数据库使用介绍	多组学分析
17	绘制miRNA、基因、转录因子调控网络，菌群共存	公共数据库获取数据转换格式,文献挖掘
21	R语言基础知识	数据读取转换
22	R语言绘制常见图形	线图、柱状图、韦恩图
23	R语言绘制常见图形	箱线图、火山图、富集分析泡泡图
24	PCA富集分析	数据准备、代码解析和结果解读
25	分组、时间序列和数量性状GSE	原理、操作和结果解读
26	绘制常见图形和排版	可自己提需求
31	Linux基础操作	常用命令解析，windows下操作
32	Linux软件安装	服务器操作
33	Sed,awk操作	ID转换、文件格式转换
34	Linux命令练习	准备常见绘图所需文件
35	WGCNA基因共表达分析	表型关联
36	扩增子和宏基因组扩充	基本概念及应用，和常见图表解读
37	考试、圆桌论坛	自评学习效果、知识点回顾
41	答疑-线上	答疑、考试内容串讲

生物信息是什么，能解决哪些问题，有哪些应用
高通量测序有哪些类型和应用，smRNA-seq，RNA-seq, GRO-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, Hi-C，scRNA-seq, ChIA-PET, FAIRE-seq, Ribo-seq, ChIRP, CAGE-seq, Clip-seq等等很多为解决特定问题而生的技术。
不同代次高通量测序技术的原理和优缺点
从细胞和DNA结构阐释生信在解析生物分子调控中的应用
其它您想了解的生信知识 (可报名时提出，也可现场提出)
CNS多组学文章2篇解读 (转录组、表观修饰组和突变组)
CNS常见生物信息图形含义解读、适用范围和在线绘制