不论是文章发表还是学术报告,专业漂亮的图表无疑会给你的工作加分不少。对于常见科研作图软件,R(ggplot2包等)、Matlab、Python需编程基础; Origin、 Graphpad Prism、 Sigmaplot的图表风格为SCI风,图形界面,只需要点鼠标基本上可完成绘图操作;而Excel是面向办公大众的,图表风格偏商,需花时间做个性化调整。
个人以为Origin的绘制的初始图表是最接近发表要求的,而且,图表上所有的图形元素(小到坐标轴的gap、刻度线的朝向、长短等)基本上都可以个性化调整,有非常大的个性化调整空间。Origin有丰富的图表模板库,如果没有反复批量绘制图表的需求, Origin足以满足一般的科研工作者。
图1.部分Origin的绘制的图表(官方案例)
当然,Origin还有大量的插件,使用插件可以实现更多的统计分析和作图功能。当然,Origin自带的统计功能也很强大,比如可以做方差分析、主成分分析(PCA)、生存分析等,只不过因其作图功能太过强大而较少关注而已。
图2.部分Origin插件列表
Origin是公认的绘制科研图表的专业软件,具有一定的学习门槛。初学者要学习Origin,免不了花时间花精力去寻找教程资料。网上虽也能找到相关的Origin视频教程,但数量较少且都是10多年前的版本。
本课程从前面部分基础操作部分到后面的案例提高部分,皆以实例作图的形式贯穿始终,在操作过程中介绍作图的思路和技巧。为了方便大家练习使用,课程提供示例图表的工程文件和相关插件。另外,因为软件是英文界面,课程中会附加界面中英文词汇的翻译,以便于初学者理解记忆。
图3.基本的图表图形元素
本课程适用于从未接触过Origin但想画出发表级图表的萌新、正在写论文想快速上手出图的研究生,以及那些对图表美观程度有极致要求的学者。希望学完之后能举一反三,绘制出范例中没有的,更具个性化的图表,比如重绘单细胞t-SNE散点图、拟时间热图、GSEA点线图等。
图4.绘制t-SNE散点图和GSEA点线图
以下图表也都是由Origin绘制的:
图4.部分使用Origin绘制的图表
最后,提醒大家这是实操课程,不是讲座,电影或是综艺节目!请边看视频边跟着操作,如果只用眼睛看,无聊、也没有意义,一觉醒来,了无痕迹!课堂中用到的示例文件可通过视频窗口左侧(或下方)的资料区下载,学习过程中有任何疑问,都可在课程页面联系OmicShare客服。