当下游的基因研究积累到一定经验之后,我们往往开始关注上游存在的调控机制。表观遗传学是诠释可遗传的基因表达记忆的建立和细胞代间传递的、而并非由DNA排序决定的机制的一门学科。研究涉及DNA甲基化、RNA甲基化、DNA-蛋白相互作用、染色质可及性、组蛋白修饰等方面,以解读位于基因型和表型之间的规律。本系列课程将重点介绍表观组学研究的方法及应用。
转录组测序后该做什么?当下游的转录研究累积到一定经验之后,我们往往开始关注转录组的上游--转录前调控。转录因子与DNA结合介导基因的转录过程,是转录前调控的重点研究对象,第一章为大家详述挖掘转录因子调控位点的新技术:DAP-seq。
在基因组开放性检测的方法中,目前最强大最主流的技术是ATAC-seq。ATAC-seq(染色质易开放区域测序)是利用Tn5转座子酶对基因组的染色质进行切割并引入测序接头,然后构建文库,对基因组上的开放染色质进行测序的一种技术。ATAC-seq将表观研究的本质聚焦到染色质的易接近性变化,是联系复杂表观/转录调控与转录组变化的关键点,可将表观遗传研究化繁为简。第二章为大家讲解ATAC-seq专题。第三章重点介绍DNA甲基化研究,最后通过文章案例分享表观研究思路。
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