TCGA数据库CNV拷贝数变异分析

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森莘

森莘

生物信息学视频教学,TCGA数据库挖掘,GEO芯片分析,miRNA靶基因预测,lncRNA功能预测。
简  介 TCGA数据库拷贝数变异分析,讲解TCGA数据库CNV简介,数据下载,基因注释,数据整理合并,卡方检验输入文件准备,正常和癌症的CNV差异,圈图输入文件准备,CNV圈图绘制,提取差异基因的CNV矩阵,差异CNV基因和表达数据合并,CNV和表达水平的相关性检验,CNV和表达水平的可视化,基因名字转换成id,GO富集分析,KEGG通路富集

适用人群

TCGA数据挖掘的科研人员,癌症相关研究人员,生物信息学分析员,生物、计算机相关专业师生,医学研究人员

课程概述

TCGA数据库拷贝数变异分析视频(copy number variant/CNV/生物信息学/圈图),讲解TCGA数据库CNV简介,数据下载,基因注释,数据整理合并,卡方检验输入文件准备,正常和癌症的CNV差异,圈图输入文件准备,CNV圈图绘制,提取差异基因的CNV矩阵,差异CNV基因和表达数据合并,CNV和表达水平的相关性检验,CNV和表达水平的可视化,基因名字转换成id,GO富集分析,KEGG通路富集分析。
同时提供课程需要的脚本文件,老师在线回答学员问题。 
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。 

* 课程提供者:生信自学网-速科生物

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