单细胞组学综合

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老师介绍

  • 周老师

    周老师

    OmicShare在线课堂首席讲师,江湖人称“周老师”。有丰富的高通量测序数据挖掘经验,精通统计学、R语言、重测序等领域。现为广州基迪奥生物技术总监,负责公司基因组、转录组、表观组和蛋白组项目设计。曾经参与项目并发表文章在nature、PNAS、BMC genomics、Genomics等期刊。
简  介 单细胞多组学被评选为2019年nature methods年度技术,体现了单细胞多组学对生命科学领域研究的重要性,也体现了现有研究者不满足于单细胞转录组的深层次探索欲望。
近年来,单细胞转录组在越来越多的领域得到了应用,这标志着单细胞转录组正在逐渐发展成熟。单细胞转录组技术成熟的另一个标志就是更深层次的数据挖掘。

借助拟时分析、RNA速率分析、细胞通讯分析等个性化分析,可以对单细胞转录组数据进行深度挖掘,实现多种细胞类型之间的有效关联,在提高数据分析目的性的同时丰满文章的完整性。


 



单细胞多组学被评选为2019年nature methods年度技术,体现了单细胞多组学对生命科学领域研究的重要性,也体现了现有研究者不满足于单细胞转录组的深层次探索欲望。

单细胞多组学并不是将各个单细胞组学简单罗列,而是通过生物学意义将独立的多个组学串联成一个有机的整体,才能将简单的1+1+1升华为(1+1+1)!

近几年,针对单细胞级的组学研究,已经有了越来越多的研究方法,诸如单细胞转录组、单细胞ATAC-seq、单细胞免疫组库、空间转录组等等。如何综合利用相关组学内容完成生物学研究的数据挖掘、提升文章档次,将是本系列课程的主题之一。



 
单细胞转录组打开了单细胞级组学研究的大门,随后,单细胞级的ATAC-seq、免疫组库、表面蛋白等组学研究也逐渐在科研项目中得到应用。这些单细胞组学技术使得研究者具备了在单细胞水平解析样本的染色质特征和蛋白质特征的能力,为转录组研究提供了更丰富的研究方向。

三维结构在生物学研究中一直有着举足轻重的地位,在医学检验中的CT技术、造影技术提供了三微视角的病理分析,在生物学研究中的蛋白晶体技术提供了单分子的三维结构信息;免疫组库测序是以T淋巴细胞或B淋巴细胞为研究目标,通过多重 PCR或5’RACE技术特异性扩增TCR/BCR所有CDR3可变区,再结合高通量测序技术,分析编码CDR3区的DNA/RNA序列及序列的丰度,获得机体的免疫特征,全面评估免疫系统的多样性。



 
 

 

* 课程提供者:基迪奥生物