ChIP-seq表观组分析

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ChIP表观分析2

支持随到随学,12月25日过期

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课程概述

课程目录

学员评论

简  介 本课程为ChIP-seq表观组分析前2天的课程,所以命名为上,如果想看全集请看无上标示的课程。本视频设计表观组学研究概念,大牛文章解析,ChIP-seq流程实战,ATAC-seq流程,超级增强子鉴定,群体讨论。

在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在2018年4月14日在北京鼓楼推出《ChIP系列高通量测序分析专题培训》,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个表观修饰实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析,独创线下集中授课2天+自行练习5天+再集中讲解答疑2天三段式教学,真正实现独立分析大数据。

关于学习生物信息学分析的重要性,请阅读《生物信息9天速成班—成为团队中不可或缺的人》

课程简介

请详细阅读课程简介,如果以下内容您全精通,不必参加此培训。

一、表观组学研究现状

  1. 表观组学研究技术介绍

  2. RoadMap/ENCODE计划介绍和资源利用

  3. ChIP系列(ChIP, ATAC, DNAseI, MNase)高通量测序技术的原理和应用

  4. 转录因子和组蛋白调控原理

二、ChIP-seq测序技术原理和实验设计

  1. ChIP-seq分析流程概述

  2. ChIP-seq分析案例分享

  3. ChIP-seq设计原理

二、ChIP-seq分析流程实战

  1. 测序数据质量评估

  2. 测序数据比对回基因组

  3. 比对质量评估和数据可视化

三、ChIP质量评价

  1. 抗体富集效率评估

  2. 样品相关性分析

四、 ChIP图谱分析

  1. 所有样品基因区修饰分布热图

  2. 所有样品转录起始位点上下游修饰分布热图

  3. Meta-gene图谱

  4. 研究的调控因子在常见调控元件如增强子、超级增强子区域的分布

五、Peak和差异修饰区域鉴定

  1. peak鉴定:peak注释、修饰基因功能富集分析、motif分析

  2. 差异修饰区域鉴定和功能分析

基本流程见ChIP-seq基本分析流程,本次课程将在此基础上做出更多拓展和深入。 如果您有关注的问题,也请报名时提出,把这次课程变成您的定制讲解。

主讲教师

主讲老师包括中科院微生物所、遗传发育所、基因组所、生物物理所等多名本领域一线技术专家。

助教团队

十余名科学院、清华、北大博士(含在读),轮值讲师和助教,辅助学员学习和矫正培训过程中不足的点。

培训时间

2018-04-14 到 2018-04-15 (线下讲解实战)

2018-04-21 到 2018-04-22 (可线上线下同时,照顾不能长时间在北京的朋友)

独创线下集中授课2天+自行练习5天+再集中讲解答疑2天+后期学习群的四段式教学,并提供学习视频,教、学、练、答结合,真正实现独立分析大数据。

每天早9点到晚5点,半封闭式教学

资料下载报名后支持下载

* 课程提供者:陈同

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