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本课程内容
本课程介绍的是基于Docker虚拟机,从NCBI上SRA数据库下载高通量测序数据,为生信数据挖掘打下基础:
- SRA数据库简介
- SRA Toolkit下载
- 迅雷下载
- wget下载
- SRA数据转换为fastq格式
Docker工具支持跨平台使用
学会docker之后,分析软件可在windows,MAC 苹果系统,linux系统中运行。一次学习为今后生物信息分析打下坚实的基础。
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琪➡储姜尚
课程顾问
组学大讲堂资深生信分析工程师,擅长:R语言、TCGA数据挖掘、GEO数据挖掘、perl语言、基因家族分析、linux、chip-seq、RNA-seq、重测序等生信相关数据分析。
本课程介绍的是基于Docker虚拟机,从NCBI上SRA数据库下载高通量测序数据,为生信数据挖掘打下基础:
学会docker之后,分析软件可在windows,MAC 苹果系统,linux系统中运行。一次学习为今后生物信息分析打下坚实的基础。
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