MapMan植物通路注释软件使用教程

559人 购买 好评度 -
用手机看

扫一扫继续用手机看

  • 微信扫码

  • QQ扫码

下载手机APP
收藏
  • 第一期
更多班级

第一期

支持随到随学,21年06月过期

¥37.72

本班因教学质量问题暂时不能报名。 查看详情

课程因违反平台规定暂时不能报名。

立即购买

课程概述

目录

往期学员作业()

评论

老师介绍

  • zhenzq

    zhenzq

    生物大数据时代已经到来,高通量测序的海量数据需要我们去挖掘,这时候一个熟练掌握生信分析技能的人,必将在实验室发挥巨大的作用。
简  介 MapMan是一个针对植物,对基因在生物体代谢途径和生物过程中的功能进行分类的工具,它采用了层次分类的方式,对基因产物进行功能分类,目前涉及的通路分类等主要是36个BINs(可以理解为36个大类),其下分为subBINs。

组学大讲堂课程,累计满1000元可联系微信“532812110”开具发票。
本课程主要介绍如何利用MapMan实现基因的功能注释,绘制相应的通路图并于通路图上显示出map到的基因的表达量情况。主要内容涉及:

1、MapMan的安装

      (软件安装与首次启动后文件的下载)

2、相关主体文件的介绍

     Experiments ——samples data  实验方式获得的表达数据或者差异表达的log2FC等等;

     pathways—— MapMan 注释通路分类对应的通路图片显示文件,涉及具体的图片和图片相关的xml文件;

     Mappings ——MapMan提供的模式植物,或用户自己通过注释获得的mapping文件,具体内容为相关基因在不同通路上的注释情况,在通路上具体map到的位置。

3、可视化操作

     获取相关文件导入并结合具体通路查看基因的注释情况,并显示出相关基因的表达情况。



资料下载报名后支持下载

* 课程提供者:组学大讲堂