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讲师介绍

  • 中国科学技术大学细胞生物学博士,circRNA微信公众号主要撰稿人之一。擅长捕捉和把握最新科研动态,拥有丰富的课题设计和操作经验。从事肿瘤生物学,干细胞生物学相关研究10余年,曾主持或参与国家自然科学基金、中科院先导专项和973项目等多项科研项目。在Cell Metabolism, Cancer Science 等期刊发表多篇论文。

  • 具有扎实的分子生物学实验技能和丰富的circRNAs研究经验。擅长lncRNAs、circRNAs功能研究,circRNA过表达载体构建与验证,circRNAs翻译蛋白质的验证与分析。

  • 发表多篇SCI及核心期刊文章,参与多项circRNA相关测序项目研发及专利撰写。擅长不同测序样本抽提质检及文库构建,对外泌体、血清血浆、RIP/ChIP实验来源的微量样本有丰富的抽提与建库经验。

  • 从事生物学信息学平台的搭建、流程开发以及项目分析等工作,熟悉多种二代测序,擅长运用shell、R等编程语言进行生物数据挖掘。

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    课程大纲

    一、circRNA如何被翻译的?

    1.  RNA翻译机制概述
    2.  不依赖5’-帽子的翻译机制
    3.  circRNA的翻译起始
    4.  circRNA的ORF

    二、翻译组学在circRNA翻译研究中的应用
    1.  翻译组学概述
    2.  常见翻译组学技术概述
    3.  翻译组学用于circRNA翻译研究4.  常见翻译组学数据库简介

    三、核糖体测序技术流程与注意事项
    1. 核糖体测序技术简介(Ribo-seq  or RNC-seq?)
    2. Ribo-seq实验核心步骤解析
    3. Ribo-seq实验数据质控分析

    四、RIbo-sep 解密翻译之生信分析
    1. Ribo-seq生信基础分析
    2. 常用工具及数据库
    3 .非编码RNA的编码潜能

    五、如何验证circRNA的翻译?(基础篇)
    1. circRNADb数据库的使用
    2. ORF和序列分析
    3. 载体构建与初步验证

    六、如何验证circRNA的翻译?(提高篇)
    1. circRNA翻译蛋白质(多肽)的检测与验证
    2. 翻译起始及其机制的验证
    3. 翻译过程的调控与验证

    七、如何验证circRNA的翻译?(检测抗体篇)
    1. 自制抗体的要求与注意事项
    2. 如何查找适用的商业化抗体
    3. 用抗体去发现可翻译的circRNA

    八、circRNA翻译产物功能研究思路
    1. circRNA翻译产物与母基因的关系
    2. 新多肽的序列预测分析 
    3. 新多肽的定位与互作分子分析 
    4. 新多肽的功能研究思路