Python和R是一对数据科学两大语言,在互联互通的路上,我感觉R更加的积极。在Python使用R语言语法有些不自然,但在R中调用Python体验十分棒,一起跟我看看吧。
reticulate包是可以让R语言非常流畅自然联通Python的关键。
Rmarkdown预备知识
Rmarkdown很像jupyter notbeook和markdown的结合。
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代码块 -
markdon文本
代码块
在Rmarkdown中的代码块的开始都是以三引号、{}和语言名为标志,以三引号结尾。
```{r} library(ggplot2) ggplot(mpg, aes(x=displ, y=cty))+ geom_point()
```
后面设置好reticulate包后,就可以在Rmarkdown中使用python代码块,
```{python} import pandas as pd df = pd.read_csv('test.csv') df.head()
```
markdown文本
文本部分全部支持markdown语法,这里不做赘述。
安装
```{r} install.packages("reticulate")
```
环境设置
当我们在R代码块中设置好Python环境,就可以在Rmarkdown中跑Python代码。
查询Python
首先我们需要知道Python安装路径,可以在命令行中逐行执行下面代码
python3
import sys
sys.executable
我的mac电脑的Python安装路径为
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/bin/python3
指定Python
执行下方的代码(路径改为自己的Python安装路径)
```{r} library(reticulate) use_python('/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/bin/python3')
```
执行代码后,我们就可以愉快的使用Python代码
运行Python代码
在Rmarkdown中写Python代码块
作图
```{python} import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt # 计算正弦曲线上点的 x 和 y 坐标 x = np.arange(0, 3 * np.pi, 0.1) y = np.sin(x) plt.title("sine wave form") # 使用 matplotlib 来绘制点 plt.plot(x, y) plt.show()
```
读取csv
```{python} import pandas as pd df = pd.read_csv("test.csv", encoding="gbk") df.head()
```
返回的df是Python对象,我们可以看到表格不好看,这是R中的Python对象。
在R代码块中调用Python变量(对象)
刚刚讲的都是在Rmakdown中运行Python代码块,并不是在R代码块中运行Python代码或者调用Python变量。
py$python_variable_name
R代码块中调用Python方法
py$python_variable_name
-
py相当于Python中的对象 -
$ 相当于Python中的点 -
python_variable_name 是Python代码块中的变量名
比如在上文中Python的变量df,在R中调用
```{r} py$df
```
现在调用Python对象df时,R会默认将其转为R对象,所以内容一样,样式似乎变好看了。
R代码块中导入Python库
使用os库的listdir函数查询当前项目文件夹内的文件列表
```{python} import os os.listdir()
```
['reticulate学习.md', 'test.csv', 'test.py', 'reticulate学习.html', 'reticulate学习_files', 'reticulate.pdf', 'reticulate学习.Rmd', 'data.py']
在R代码块中实现上方的Python功能,如下,很简单
```{r} library(reticulate) #导入库 os <- import("os") #os库的listdir函数 os$listdir()
```
## [1] "reticulate学习.md" "test.csv" "test.py"
## [4] "reticulate学习.html" "reticulate学习_files" "reticulate.pdf"
## [7] "reticulate学习.Rmd" "data.py"
可以发现
-
import("os)
代替了import os
-
$
代替了.
-
<-
代替了=
再熟悉一下
```{r} library(reticulate) pd <- import("pandas") df2 <- pd$read_csv("test.csv", encoding="gbk") df2
```
需要注意的是,在R代码块中执行Python代码时,默认会将Python对象转为R对象。
source_python()
使用reticulate包中的source_python('py文件路径')可以导入py文件中的变量,这样就可以在R代码块中使用外部变量。例如我在data.py中准备A和B两个字符串
A = '我是张三,'
B = '来自河北'
在R代码块中运行data.py
```{r} library(reticulate) source_python("data.py") print(A) print(B) paste0(A, B)
```
我是张三,
来自河北
我是张三,来自河北
py_run_file()
在R代码块中运行项目文件夹中的test.py文件,该文件内只有
print('这是来自test.py的问候!')'
这一行代码,在代码块中运行```{r} library(reticulate) py_run_file("test.py")
```
得到
这是来自test.py的问候!