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讲师介绍

  • OmicShare在线课堂策划人——小圆,从事高通量测序行业多年,目前主要从事高通量测序相关产品推广。

  • OmicShare在线课堂首席讲师,江湖人称“周老师”。有丰富的高通量测序数据挖掘经验,精通统计学、R语言、重测序等领域。现为广州基迪奥生物技术总监,负责公司基因组、转录组、表观组和蛋白组项目设计。曾经参与项目并发表文章在nature、PNAS、BMC genomics、Genomics等期刊。

  • 课程详情

    谈谈RNA-seq和GWAS中的 p value 和 Q value

    二代测序数据是典型的大数据,统计是数据分析的基础。不同情况的P value估算是最常见的分析,例如:差异表达分析下的p value,gwas下的p value。由于检验次数的增加,多重检验校正又成为数据分析的必要步骤,于是Q value,adjusted p value,FDR等这些名词又冒了出来。有时候,大家都觉得晕啊!也许你可能遇到过这样的问题:

    “Q value 为什么大于 p value呢”
    “FDR 怎么大于1,是否分析出错了?”
    “我的kegg 富集分析,FDR < 5%找不到关注的pathway,是否可以放宽阈值呢?”
    “审稿人说,我的结果使用p value判断是不对的,必须使用多重检验校正后再判断是否显著”
    ... ...

    如果你也遇过这些疑问,欢迎参加我们的在线讲堂。相信1个小时后,你将会豁然开朗。



    本期在线交流的内容包括:

    (1) 统计的基本概念
       功能富集分析是什么逻辑?
       当没有先验分布的时候,怎么估算置信区间(permutation、bootstrap等相关的方法)
    (2)多重检验的目的
    (3)多重检验的方法有哪些?
        FDR、Q value、adjusted p value这些概念的由来和关系;
        P vaLue 和 Q value的区别;
        如何选取Q value的阈值标准;
        如何从p value估算Q value;

    欢迎大家加入QQ群与嘉宾交流切磋~ 交流QQ群 67185986